Nathaniel blev gift med Mary Bissell den 8 feb. 1720 i Colchester, New London, Connecticut, USA. Mary (datter af Daniel Bissell og Margaret Dewey) blev født den 27 nov. 1701 i Windsor, Hartford, Connecticut, USA; døde den 7 nov. 1771 i East Windsor, Hartford, Connecticut, USA. [Gruppeskema] [Familietavle]

1. Elisha Gilbert blev født den 25 maj 1736 i Coventry, Tolland, Connecticut, USA; døde den 6 jan. 1778 i Valley Forge, Philadelphia, Pennsylvania, United States.
2. Lois Gilbert blev født den 8 okt. 1727 i Coventry, Tolland, Connecticut, USA; døde den 24 feb. 1790 i Tolland, Tolland, Connecticut, USA.
3. Mary Gilbert blev født den 19 nov. 1721 i Colchester, New London, Connecticut, USA; døde den 24 jan. 1793 i Plainfield, Windham, Connecticut, USA.
4. Thomas Gilbert blev født den 25 sep. 1731 i Coventry, Tolland, Connecticut, USA; døde efter nov. 1773.
5. Samuel Gilbert blev født den 13 jan. 1723 i Colchester, New London, Connecticut, USA; døde i 1778 i Barnstable, Barnstable, Massachusetts, USA.
6. Ebenezer Gilbert blev født den 3 aug. 1733 i Coventry, Tolland, Connecticut, USA; døde den 12 maj 1812 i Middletown, Middlesex, Connecticut, USA.
7. Nathaniel Gilbert blev født den 3 okt. 1725 i Coventry, Tolland, Connecticut, USA; døde den 26 feb. 1785 i Southwick, Hampden, Massachusetts, USA.