Johnston blev gift med Mary B Brewster den 15 nov. 1847 i Plymouth, Plymouth, Massachusetts, USA. Mary (datter af Job Brewster og Mary Oldham) blev født den 26 dec. 1829 i Duxbury, Plymouth, Massachusetts, USA; døde den 8 feb. 1880 i Plymouth, Plymouth, Massachusetts, USA. [Gruppeskema] [Familietavle]

1. William J Brown blev født den 12 jan. 1848 i Plymouth, Plymouth, Massachusetts, USA; døde den 12 sep. 1848 i Plymouth, Massachusetts, USA.
2. William J. Brown blev født den 28 dec. 1849 i Plymouth, Plymouth, Massachusetts, USA; døde den 18 jul. 1875 i Plymouth, Massachusetts, USA.
3. Mary S Brown blev født den 30 mar. 1852 i Plymouth, Plymouth, Massachusetts, USA; og døde.
4. Charles Foster Brown blev født den 30 jun. 1854 i Plymouth, Plymouth, Massachusetts, USA; og døde.
5. Irving W Brown blev født i 1868 i Plymouth, Plymouth, Massachusetts, USA; døde den 15 okt. 1901 i Brockton, Plymouth, Massachusetts, USA; blev begravet i 1901 i Plymouth, Plymouth, Massachusetts, USA.
6. Henry Barstow Brown blev født den 29 nov. 1873 i Plymouth, Massachusetts, USA; døde i 1948; blev begravet i 1948 i Wareham, Plymouth, Massachusetts, United States.