Jonathan blev gift med Elizabeth Barker den 16 okt. 1708 i Newbury, Essex, Massachusetts, USA. Elizabeth (datter af Richard Barker, Jr og Hannah Kimball) blev født den 11 feb. 1689 i Andover, Essex, Massachusetts, USA; døde den 18 jun. 1732 i Andover, Essex, Massachusetts, USA; blev begravet i jun. 1732 i Andover, Essex, Massachusetts, USA. [Gruppeskema] [Familietavle]

1. Ann Farnum blev født i 1727 i Andover, Essex, Massachusetts, USA; døde den 2 nov. 1777 i Pelham, Hillsborough, New Hampshire, USA.
2. Daughter Farnum blev født i 1720 i Andover, Essex, Massachusetts, USA; døde i 1720 i Andover, Essex, Massachusetts, USA.
3. Elizabeth Farnum blev født den 9 nov. 1711 i Andover, Essex, Massachusetts, USA; døde den 5 dec. 1780 i Methuen, Essex, Massachusetts, USA.
4. Sarah Farnum blev født den 23 okt. 1710 i Essex, Massachusetts, USA; og døde.
5. Johnathan Farnum blev født den 21 nov. 1720 i Andover, Essex, Massachusetts, USA; døde den 10 dec. 1720 i Andover, Essex, Massachusetts, USA.
6. Rebecca Farnaum blev født i 1710 i Andover, Essex, Massachusetts, USA; døde den 25 feb. 1785.
7. Hannah Farnum blev født i Andover, Essex, Massachusetts, USA; døde den 6 dec. 1808 i Andover, Oxford, Maine, USA; blev begravet i dec. 1808 i Andover, Oxford, Maine, USA.