Samuel blev gift med Holly Ann Murphy den 1 maj 1855 i Weakley, Tennessee, USA. Holly (datter af Emanuel Masters Murphy og Nancy Judd Eastus) blev født den 30 mar. 1834 i Weakley, Giles, Tennessee, United States; døde den 30 okt. 1900 i Farmington, Davis, Utah, USA. [Gruppeskema] [Familietavle]

1. John Mark Baxter blev født den 28 apr. 1869 i Dresden, Weakley, Tennessee, USA; døde den 5 feb. 1935 i Salt Lake City, Salt Lake, Utah, USA.
2. Samuel Emerson Baxter blev født den 10 aug. 1858 i Dresden, Weakley, Tennessee, USA; døde den 17 sep. 1928 i Salt Lake City, Salt Lake, Utah, USA.
3. Joseph Curd Baxter blev født den 13 jan. 1857 i Tennessee, USA; døde den 22 jan. 1857 i Tennessee, USA.
4. Sarah Francis Baxter blev født den 9 jul. 1864 i Tennessee, USA; døde den 17 okt. 1881 i Salt Lake City, Salt Lake, Utah, USA.
5. Charles Henry Baxter blev født den 31 dec. 1866 i Dresden, Weakley, Tennessee, USA; døde den 30 dec. 1929 i Salt Lake City, Salt Lake, Utah, USA.
6. Louisa Ellen Baxter blev født den 31 aug. 1862 i Weakley, Tennessee, USA; døde den 30 apr. 1863 i Tennessee, USA.
7. Nancy Victoria Baxter blev født den 28 maj 1861 i Tennessee, USA; døde den 30 jul. 1861 i Tennessee, USA.