Johannes blev gift med Henderickje Van Buren den 15 nov. 1766. Henderickje (datter af Jan Van Buren og Angiety Conyn) blev født i 1733 i Albany, Albany, New York, USA; blev døbt den 3 aug. 1746 i First Dutch Reformed Church, Albany, Albany, New York, USA; og døde. [Gruppeskema] [Familietavle]

1. Annatje Beekman blev født den 29 nov. 1779; blev døbt den 2 jan. 1780 i First Dutch Reformed Church, Albany, Albany, New York, USA; og døde.
2. Leendert Beekman blev født den 24 jun. 1777 i First Dutch Reformed Church, Albany, Albany, New York, USA; og døde.

Familie/Ægtefælle/Partner: Ukendt. [Gruppeskema] [Familietavle]

1. Johannes Beekman blev født den 6 okt. 1771 i Schodack, Rensselaer, New York, USA; og døde.
2. Henry Beekman blev født i 1774 i Rensselaerwyck, New York; døde den 14 mar. 1857 i New York, New York, New York, USA.